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一、飼料轉化率低、養殖成本大幅增加
二、濫用抗生素
1、誘發細菌耐藥 病原微生物為躲避藥物在不斷變異，耐藥菌株也隨之產生。目前，幾乎沒有一種抗菌藥物不存在耐藥現象。
2、肝臟損害 抗生素吸收后在肝臟代謝，故肝臟易受抗菌藥物損害。
3、腎臟損害 藥物經腸道吸收，吸收后均以原型或代謝物經腎臟排泄，故腎臟最易受到藥物損害。
4、神經系統損害 中樞神經系統、聽力、視力、周圍神經系統病變以及神經肌肉傳導阻滯作用等。
5、血液系統損害 各類抗生素在長期和大量應用時都可以影響血細胞的生成，致血細胞減少，包括白細胞及粒細胞減少、血小板減少及全血細胞減少即再生障礙性貧血。
6、消化道反應 多見惡心、嘔吐、腹脹、便秘等,幾乎所有抗生素都可引起。
三、飼料質量觀難把控、霉玉米隱形危害
1.產生有毒的代謝物，改變飼料的營養組分，降低動物對養分的利用，使養分利用率最少下降10％；
2.造成畜禽采食量減少、嘔吐，甚至拒食飼料；
3.、生長緩慢和飼料利用率降低；
4.種畜禽生殖系統破壞、繁殖力低下甚至失去生殖能力；
5、免疫抑制，畜禽抗病能力下降；
6、中毒嚴重者導致孕畜流產，甚至死亡
四、腸道疾病頻發死亡淘汰率高
1.畜禽拉稀消化不良使養分利用率最少下降10%造成畜禽采食量下降、嘔吐、拒絕采食
2.種畜禽生殖系統被破壞、繁殖力低下甚至失去繁殖能力
3.免疫抑制、畜禽抗病力下降
五、氨氣超標呼吸道疾病頻發
1.影響豬生長性能
2.降低機體抵抗力
3.誘發疾病
4.影響疫苗的免疫效果
5對環境及人體危害
六、畜禽亞健康，隱形疫情揮之不去
近十年畜牧業產值平均以10%速度增長，但是我國由于疫情造成畜禽死亡率比西方國家至少高出1倍，由于多病源混感，影響畜禽產品的質量對人體健康造成極大的危害部分原有病毒病在流行過程中未能充分掌握其病原體的變異規律常引起誤診和免疫失敗、從而造成巨大損失
