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(一)發病原因
口蹄疫病毒(foot-and-mouth disease virus，FMDV)屬于小RNA病毒科口瘡病毒屬(aphovirus genus)，外形呈球形，正20面體對稱，直徑30nm，無囊膜，分子量為6.9×106，完整的病毒為單鏈RNA，基因長度為8.5kb，完整病毒顆粒核酸占30%，蛋白質占70%。結構基本明了，由5UTR、3UTR和ORF組成，其中ORF內含VP1結構基因，VP2、VP3非結構基因和起始密碼號和終止密碼子等。VP1與病毒的免疫原性有關，也是病毒主要抗原所在位點。
病毒多型，有7個血清型，65個亞型，其7個血型為A、O、C，南非SATⅠ、SATⅡ、SATⅢ、亞洲Ⅰ型，以O型為常見。A型又分為32個亞型，O型11個亞型，C型5個，南非Ⅱ型3個，亞洲Ⅰ型3個亞型，最近報道口蹄疫亞型已增加到70個以上，各型無交叉免疫現象。
病毒對外界環境抵抗力很強，自然條件下，含毒組織和受污染的廢料其傳染性可達數月，高溫和陽光對病毒有殺滅作用，酸、堿對病毒有較強的殺滅作用，1%～2%氫氧化鈉溶液，30%草木灰水，1%～2%甲醛溶液有效，酚、乙醇、氯仿無效，該病毒對熱敏感，60℃ 30min滅活，80～100℃立即滅活。
(二)發病機制
病畜經損傷皮膚和消化道黏膜感染人體繁殖并擴散附近細胞，在皮膚上形成水皰，然后病毒進入血液引起病毒血癥和皮膚、器官組織病變和相應癥狀，胃和大小腸黏膜可見出血性炎癥。另外，具有診斷意義是部分病毒有心肌病變，心包膜有彌散性及點狀出血，心肌切面有灰白色或淡黃色斑點或條紋，好似老虎身上的斑紋，故稱虎斑心。
