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為7.7%，偽狂犬病毒為8.0%;育肥豬圓環病毒為44.8%，變異藍耳病毒為24.2%，經典藍耳病毒為11.6%。
不過陳煥春認為，與病毒性疾病相比，細菌性疾病更為復雜，危害更大;尤其是細菌性疾病混合感染不容忽視，在豬群發病致死中扮演著重要角色，致病菌對各階段豬群的致死性作用，各菌群血清型差異較大。且長期以來養豬業過分依賴藥物，全程濫用抗生素保健、治療，導致細菌耐藥性日趁嚴重，出現致病菌耐藥譜廣，部分細菌病甚至已無藥可治，引發公共衛生問題備受關注。
據了解，陳煥春及其帶領專家團隊通過實驗室調查統計表明，2003-2011年共分離鑒定細菌10817株，其中鏈球菌4274株(39.51%)、副豬嗜血桿菌3088株(28.55%)、腸外致病性大腸桿菌1213(11.21%)、巴氏桿菌652株(6.03%)，這幾種細菌已經成為影響國內養豬生產的主要病原菌，另外胸膜肺炎、沙門氏菌等常見病原菌也嚴重威脅規模化養殖業的健康生產。
陳煥春強調，養殖戶應該重視細菌性疾病防控，如果細菌性疾病控制好，即使有藍耳圓環等病毒性疾病，豬場疾病也相應較容易控制。具體到鏈球菌和副豬嗜血桿菌這兩類主要細菌性疫病時，陳煥春介紹目前主要是以注射疫苗防控為主，不過要針對細菌血清型不同用對疫苗。據該實驗室臨床分離豬鏈球菌的血清定型情況看，2型鏈球菌所占比例為57%，屬于已分離出型鏈球菌中的優勢血清型;7型和9型鏈球菌，所占比例為19.2%和18.8%。
副豬嗜血桿菌的血清型則最為復雜，各個血清型之間免疫交叉保護力很低。不同地方分離的相同血清型的菌株毒力與抗原性也可能不完全相同，具有地方特異性不同區域有不同的表現，其中湖北以4、13、5型為主，占62.41%比例;浙江以5型為主占40.25%，其次為4型占25.97%;河南以4、13型為主，其中4型占28.81%。
