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豬群的健康狀況差隨著養豬業的發展，我國豬群的健康狀況每況愈下，帶毒豬和亞健康豬增多。表面健康豬往往給免疫帶來災難，由防疫應激引發的疾病非常普遍。為了盡可能地降低損失，可以在豬群健康不是很明朗的時候，盡量減少疫苗注射時的應激，如提前注射或飼喂抗應激藥物，在注射時盡量避免動作粗暴等。
防疫程序不合理 一直以來，對豬藍耳病的免疫程序都較混亂，應根據各豬場的具體情況進行適時免疫。比較成功的免疫程序是凍干苗和滅活疫苗相結合的方式。
疾病所特有的免疫機理 就現在豬群而言，藍耳病的陰性場可以說是基本上不存在，如果用滅活疫苗進行免疫，則極有可能引起發病，而且接種滅活疫苗后，一般在28天后才能產生抗體。所以應該用產生抗體較快的凍干苗作為基礎免疫，用滅活疫苗進行加強的辦法進行免疫。
疫苗本身的免疫缺陷 不管是凍干苗還是滅活疫苗，對藍耳病的免疫都存在一定的缺陷。凍干疫苗抗體產生得快，但是對現行流行毒株的保護較差；滅活疫苗針對性強，但是抗體產生得慢，而且注射應激較重，往往還沒有產生保護就已經發病。
免疫壓力過重 目前豬病較多，一些飼養戶為慎重起見，往往要給豬接種多種疫苗，不僅使免疫應激加重，而且使免疫壓力過重，從而導致免疫失敗，因此應該根據當地疾病流行的實際情況，有重點地選擇必要疫苗進行免疫。
環境污染重 環境污染重，豬群往往處于某些病毒的連續攻擊下，雖然體內有一定的抗體，但是由于毒力的增強和豬群健康狀況的下降，抗體始終處于弱勢。所以要控制藍耳病，不能完全依賴疫苗，而應采取綜合措施。
