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多數非常規蛋白飼料原料會有抗營養因子或毒素，必須通過適當處理才能使用。大部分是豆科籽實加工副產品，產品質量和營養價值受到加工工藝影響很大，尤其是氨基酸消化率和可利用率。氨基酸不平衡或缺乏某些限制性氨基酸，替代日糧中豆粕時，注意補充氨基酸。一般適口性差，要注意加工調制。
一、棉籽粕
1、棉籽粕的成分特性
棉籽粕營養價值受到棉酚和環丙烯脂肪含量的影響。纖維含量隨去殼程度而不同。氨基酸中賴氨酸少，為第一限制氨基酸，利用率亦差。游離棉酚含量少，其粗蛋白質及賴氨酸利用率較佳。是色氨酸及蛋氨酸之優良來源，利用率比菜籽粕好。維生素A、D少。礦物質中磷多，鈣少，磷多屬植酸態磷，占71%。
2、棉籽粕的利用
對豬來說品質優良的棉籽粕可取代一半大豆粕而無不良影響，但要補足賴氨酸；品質不好或取代量太高則影響適口性，并有中毒的可能。游離棉酚含量超過0.04%的棉籽粕，在使用上必須很謹慎。產品的不穩定及棉酚毒性問題，一般乳豬、仔豬飼料不推薦使用。種畜應避免使用棉籽粕，以免影響生殖能力。
二、花生粕
1、花生粕的特點
花生粕易感染霉菌，產生黃曲霉毒素。花生殼混入量對成分影響最大。連殼花生粕因含殼多，故纖維高，能量需求高之飼料應避免使用。
2、花生粕的成分特性
花生粕的蛋白質以不溶于水的球蛋白為主(占65%)，可溶于水的白蛋白僅占7%，蛋白質性狀與大豆蛋白差異甚大。賴氨酸及蛋氨酸偏低，精氨酸與組氨酸則相當高。脂肪酸以油酸為主，約占53%～78%。維生素除A、D、C外，其他含量豐富。鈣少磷多，磷多屬植酸態。花生粕含有胰蛋白酶抑制因子，其量約為生大豆的20%，加熱即可去除。
3、花生粕的利用
對豬的適口性相當好，因賴氨酸及能量含量低，其價值低于大豆粕，仔豬可取代三分之一大豆粕。肉豬采食太多花生粕時，肉質有變差之趨向，脂肪軟化，用量以不超過10%為宜。
