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歐盟可持續畜牧生產(SABRE)課題的子課題“通過最先進的基因組學實現可持續性動物育種”的最終報告解釋了如何應用最新的基因組學工具在育種過程中減少公豬異味問題。
公豬異味是某些未去勢公豬的肉中的一種異味，主要由自然界中存在的兩種化合物含量高造成。本項目利用最新的基因組工具，以便找出造成未去勢公豬肉中異味的遺傳機制，最終目的是通過育種來消除公豬異味。
影響公豬異味的是什么?
一小部分(5-15%)公豬的肉烹制后會有一種令人不快的氣味和口味。因此在許多歐盟國家，雄性仔豬出生后不久都需要閹割，以避免公豬異味。
未去勢公豬的應用可大大提高豬肉生產的可持續性。如果不進行閹割，動物福利會改善。此外，因為公豬的胴體更瘦，飼料轉化效率更高，因此還能節省225萬噸飼料。然而，消費者需要我們確保豬肉的品質、氣味和口味良好。未去勢公豬肉中造成異味的主要化合物是雄烯酮和糞臭素。雄烯酮是性成熟之后睪丸產生的一種甾體激素，氣味聞起來象尿。糞臭素是后段腸道的細菌產生的，聞起來象糞。這些物質如果不能被肝臟完全代謝，就會儲存在脂肪中。公豬異味是可遺傳的，因此通過選育糞臭素和雄烯酮水平低的品系，就可以免去閹割的必要，從而實現長期可持續的畜牧生產，并最終禁止閹割。
減少公豬異味的研究
通過最新的基因組學工具對公豬異味的遺傳機制進行了研究。對公豬異味組分的小型定義基因區(QTL，數量性狀基因位)進行了繪制。這樣就能夠針對這些基因區進行選育，作為閹割的替代方案。
全基因組搜索
采用最新研發的SNP技術，Illumina 60K 串珠芯片，在不同豬品系的全基因組范圍內對雄烯酮和糞臭素有關的基因標記(SNP：單核苷酸多態性)進行了搜索。對來自丹系長白法系大白、以及來自挪威的杜洛克父系和長白父系的9000多頭動物的全部染色體范圍內的SNP進行了全染色體組關聯分析。
糞臭素之于雄烯酮
對糞臭素和雄烯酮積累方面的復雜遺傳機制進行了研究。糞臭素與雄烯酮之間存在弱遺傳相關(0.27)。這顯示，觀察到的變異是由不同的遺傳因素造成的。識別出單個SNP對糞臭素和雄烯酮的影響，這可以對不同品系當中的大部分遺傳變異做出解釋。盡管這些SNP的效果在不同品系和品種之間存在差異，但它們有助于識別出那些繼承了非常高(或低)水平的雄烯酮和糞臭素的仔豬，- 甚至在它們達到性成熟之前就可以實現。此外，通過這些SNP，可以挑選合適的種公豬，讓它產出的肥育后代形成公豬異味的風險得以降低。
育種工具
2010年底啟動了驗證研究，調查這種技術在其它品種中的效果。該項研究開發出了專用于育種的、成本效益高的SNP。最終，應能找出造成公豬異味方面重要區別的關鍵基因。
成果
發現未去勢公豬的公豬異味的遺傳機制有助于：
1、通過基因標記加快無公豬異味選育的進度
2、通過挑選種公豬來減少商品豬的異味
3、為特定市場選擇適合的品系
4、采用未去勢公豬可改善飼料轉化效率，節約資源
