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在不良環境中芽孢桿菌可先形成芽孢，處于休眠狀態，具有耐高溫、耐擠壓、耐氧化、耐酸堿等特點。在適當環境中，芽孢又可以復活，并大量繁殖。
由于生存于多種環境中，芽孢桿菌具有豐富的產酶系統，可利用多種營養物質種類，能產生蛋白酶、淀粉酶、β-葡聚糖酶、植酸酶、果膠酶和木聚糖酶等十幾種酶。利用現代基因工程技術，枯草芽孢桿菌可以于短期內大量生產任何種源的酶。目前在工業酶的生產中，枯草芽孢桿菌被用于大量生產蛋白酶、淀粉酶、植酸酶等，其產量占據總工業酶量的50%。
某些芽孢桿菌，像地衣芽孢桿菌對葡萄球菌、白色念珠菌體外實驗有很強的拮抗作用。因為地衣芽孢桿菌在生長代謝過程能產生多種抗菌物質．如短桿菌肽、枯草菌素、多粘菌素、制霉菌素和頭孢菌素C等。枯草芽孢桿菌對常見的致病性大腸桿菌、沙門氏菌和金黃色葡萄球菌都有較強的抑制作用。芽孢桿菌在生長過程中，可分泌蛋白酶、淀粉酶和脂肪酶等多種有助于消化吸收的酶類，在降低和消除抗營養因子的抗營養作用也具有重要作用。在一定條件下能產生抗逆性內生孢子，可以產生脂肽類、肽類、磷脂類、多烯類和氨基酸類等多種抗生素，對多種病原菌起到很好的抑制作用。同時能產生多種營養物質如維生素、氨基酸、有機酸、促生長因子等，參與動物機體新陳代謝，為機體提供營養物質。
芽孢桿菌在養豬飼料中的應用
主要有以下幾個方面：①調節豬的胃腸道微生態平衡。枯草芽孢桿菌的大量繁殖，分泌大量抗菌物質，通過產
酸降低腸道的pH值，從而抑制部分沙門氏菌、鏈球菌等病原菌的生長與繁殖，降低仔豬腹瀉。同時，作為好氧菌，其通過消耗氧氣，為腸源寄生的厭氧菌如乳酸桿菌、雙歧桿菌等提供無氧環境，間接促
進內源性有益厭氧菌的生長與繁殖。大量的研究結果表明，枯草芽孢桿菌對沙門氏菌、鏈球菌和梭菌等具有很強的抑制功能。②具有良好的抗病治病作用。除了通過調節胃腸道的微生態平衡降低疾病發生外，還能通過刺激腸豬的免疫細胞分泌免疫球蛋白，提高機體的免疫力，從而減少包括消化系統在內的各個系統的發病率。③提高消化率，促進豬的生長。由于枯草芽孢桿菌能分泌各種酶類，從而提高飼料中營養物質的消化率，促進豬的生長。
芽孢桿菌在環境防治中的應用
對豬糞的無公害化處理 由于芽孢桿菌生存能力強，能充分利用豬糞液中的營養物質大量繁殖，搶奪了沙門氏菌與志賀氏菌生長的生存空間和營養來源，限制了病原菌的繁殖．這種拮抗作用在生物界是普遍的。要對畜禽糞便進行無害化處理，應該對微生物之間的拮抗關系加以利用，應用地衣芽孢桿菌處理豬糞液，既能將NH3轉化為生物量，又能抑制病原菌，是一種理想途徑。因此，適當在飼料或者環境中增加芽孢桿菌，有益于豬群整體健康，像護舍安這類型的環境改良劑，噴灑在環境中，可以增加環境中芽孢桿菌數量，分解有害微生物。
