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1、仔豬缺乏先天性免疫力
新生仔豬本身沒有主動免疫機能，通常只有從初乳中獲取免疫球蛋白才能初步建立免疫力。初乳中免疫球蛋白的含量雖很高，但下降也快，仔豬腸道免疫應答能力也低下。因此仔豬受環境中病原微生物的侵襲易患病。
2、仔豬調節體溫的機能不健全，對寒冷的抵抗力差，易患病。
初生仔豬調節體溫的中樞神經系統尚未發育完善，仔豬出生20天內體溫受環境變化的影響很大：當外界環境溫度比仔豬的體溫低很多時，仔豬的體溫迅速下降，代謝減弱，機體的免疫力降低，常易發生各種疾病，特別是腹瀉病。
3、新生仔豬消化器官不發達，消化功能不完善 胃上皮細胞僅能分泌乳糖酶，胃內僅含有凝乳酸酶，胃和胰蛋白酶等消化酶皆很少，其活性也很低，胃酸缺乏，尤其是鹽酸，因此不利于抑制有害菌的繁殖。（因為仔豬胃液PH值低于4時才能有利于蛋白質消化，才能使大量病原菌滅活。）
4、規模化豬場仔豬早期斷奶綜合癥應激過強促進致病，尤其是實施早期斷奶 其環境溫度、飼料營養、管理條件未跟上需要，更易致病。研究顯示：早期斷奶應激可降低仔豬體內循環抗體水平，抑制細胞免疫力，引起仔豬抗病力減弱，容易發生腹瀉。
5、營養和飼養管理不當所致 由于母豬無奶綜合癥而導致仔豬低血糖，仔豬由不活潑到水樣腹瀉，嚴重的由虛弱發展到低溫、昏迷或神經癥狀。由于對仔豬突然強制補料或吃不良的奶汁和飼料，可導致乳豬發生誘導性腹瀉或營養性腹瀉。仔豬活潑有食欲，無全身癥狀，僅見消化不良的稀臭、粥狀糞便。
6、由細菌性病原導致：⑴黃痢 1-7日齡的仔豬發病，四季均可發病，以第一胎母豬所產仔豬或環境衛生條件較差的發病率較高；日齡越小死亡率越高。排黃色稀糞，內含凝乳小片，排糞失禁，脫水消瘦，衰竭死亡。⑵紅痢 四季可發病，主要是1-3日齡仔豬發病，多為C型魏氏梭菌產生外毒素致病，發病急劇，病程短促，大多于1-3日內死亡，排出淺紅色或紅褐色稀糞，以后排含灰色壞死組織碎片，逐步變為“米粥”狀糞便。⑶白痢 四季可發病，主要是10-20日齡仔豬發病，飼養管理差、氣溫劇變、陰雨連綿等多發，病程2-10天，以排出乳白色或灰色腥臭的糊狀稀糞為特征。⑷仔豬副傷寒 主要發生于多雨潮濕季節，多見于營養、衛生狀況差的豬場流行。主要表現為慢性結腸炎與腸型豬瘟相似的呈急性敗血癥，經1-6天死亡。
7、由病毒性原因導致： ⑴豬傳染性胃腸炎 冬春季節多發，各種年齡豬均可感染發病，日齡越小的仔豬危害越大，仔豬嘔吐、水樣腹瀉，最后脫水死亡或成為僵豬，成年豬輕度水樣腹瀉（2）輪狀病毒病 早春和晚冬季節多發，以10-20日齡的仔豬易感，新疫區偶有暴發，多為散發，成年豬多為隱性感染，仔豬嘔吐、腹瀉，糞便黃色或黑色，較腥臭，呈水瀉樣或糊狀⑶豬流行性腹瀉 各種年齡豬均可發病，多在冬春發生，夏季也偶有發生，與豬傳染性胃腸炎相比，傳播速度較慢，病死率較低，腹瀉癥狀也較輕，常與胃腸炎混合感染⑷偽狂犬病 冬春季節多發，病豬精神沉郁、嘔吐、腹瀉、發抖，部分有后退、轉圈等神經癥狀
8、弓形蟲病 夏秋季節多發，呈地區性，濕熱季節較多發，似豬瘟、流感癥狀，體溫升高稽留，腹瀉或便秘，皮膚發紺。
9、缺鐵性貧血 四季可發，以規模化豬場多發，病豬消瘦、食欲不振、便秘與下痢交替，可視粘膜蒼白。
二、預防仔豬腹瀉的綜合措施
1 、做到科學飼養，防止懷孕母豬過肥或過瘦 要獲得健壯的仔豬，必須保證母豬飼喂營養全面、均衡的飼料。（1）一般在懷孕前期應適當限飼，但此時也是胎兒組織器官形成的階段，對飼料中蛋白質和維生素的質量有較高要求，同時可多喂青綠多汁飼料。（2）懷孕后期應采用高標準飼養，以保證營養供給，促進胎兒正常發育，減少母豬脂肪消耗，為產后恢復體力和初乳積蓄營養。（3）產仔當天不要喂精料，適當飼喂麩皮湯，產后第三天起逐漸增加母豬飼喂量，可防止因母豬產后不食、便秘、缺奶而導致仔豬腹瀉。
2、做好母豬分娩前的免疫接種工作和產后母豬的護理
⑴母豬于產前40-45天注射“豬傳染性胃腸炎—流行性腹瀉—輪狀病毒”三聯苗；于產前28天注射“偽狂犬基因缺失苗”。
⑵待產母豬進入分娩舍前，必須對產欄和母豬進行徹底消毒，有條件的豬場可實行全進全出的方法，更有利于杜絕病原微生物的交叉感染。預防仔豬腹瀉的綜合措施：
⑶在產一月開始添加牲命1號，改善奶水質量。
⑷母豬進分娩舍后和臨產中，均應洗滌母豬的陰門、乳房、腹部。臨產中擦洗并按摩乳房，擠掉奶頭第一、二把奶，輔助仔豬吃上初乳，是防止母豬乳房炎和仔豬下痢的重要措施，尤其對第一胎母豬更重要。
⑸仔豬保健工作：A、應用現代飼料科技，使用含噴霧血漿蛋白、酶制小肽等成份的高質量乳豬料。B、注意保溫工作，保持豬舍干燥。C、保證良好的衛生條件。D、適當限制仔豬的采食量，防止仔豬過度采食而引起消化不良腹瀉。預防仔豬腹瀉的綜合措施：仔豬出生后3天注射鐵糖1-1.5毫升；15天再加強一次，注射2毫升，對仔豬因缺鐵而造成的貧血、腹瀉有很好的防治作用。
三、近年來對豬有害的細菌和病毒病明顯增多，其中許多可引起仔豬拉稀和母豬發病；有些疾病可用疫苗來預防，事實上豬場已經注射了不少種類的疫苗，但疫苗并不是萬能的，也不能從根本上百分之百的保證效果；因此，從長遠的觀點來說，應采取更為嚴格的豬場管理措施：如嚴格控制引種豬場的數量，確保豬場與外界嚴格隔離，分娩舍和保育舍嚴格遵守“全進全出”的管理方式，同時要搞好“生物安全”，不斷提高豬場的衛生標準。只有采取綜合性的防制措施才能培育出更多更健康的仔豬。
