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1.氟苯尼考不宜與大環內酯類（如泰樂菌素、紅霉素、羅紅霉素、替米考星、吉他霉素、阿奇霉素、克拉霉素等）、林可胺類（如林可霉素、克林霉素）及雙萜類半合成抗生素－泰妙菌素（枝原凈）聯合用藥，合用時可產生拮抗作用。
2.氟苯尼考不可與β－內酯胺類（如青霉素類、頭孢菌素類）及氟喹諾酮類（如恩諾沙星、環丙沙星、氧氟沙星等）聯合用藥，因本品是抑制細菌蛋白質合成的速效抑菌劑，后者屬繁殖期速效殺菌劑。在前者的作用下，細菌蛋白質合成迅速被抑制，細菌停止生長繁殖，使后者的殺菌作用減弱。故在治療需要發揮快速殺菌作用的時，不可同用。
3.氟苯尼考不能與磺胺嘧啶鈉一起混合肌注�？诜蚣∽⒔o藥時忌與堿性藥物合用，以免分解失效。也不宜與鹽酸四環素、卡那霉素、三磷酸腺苷、輔酶A等混合靜脈注射，以免發生沉淀和降效。
4.肌肉注射后可能引起肌肉變性、壞死，因此，可頸部與臀部深部肌肉交替注射，不宜在同一部位重復注射。
5.由于氟苯尼考可能有胚胎毒性，妊娠期及哺乳期家畜慎用。家禽在產蛋期禁用。
6.在病豬體溫較高時，可配合解熱鎮痛藥及地塞米松使用，效果更佳。
7.對豬傳染性胸膜肺炎發病初期的治療，因患病豬群還有較好的食欲條件下，使用混飼給藥，可適當提高添加量，每t飼料可添加氟苯尼考（效價）100g，（最好再配合強力霉素200g），連續使用7天，然后將劑量減半，再繼續使用2周，具有較好效果。
8.在防治豬呼吸道綜合征（PRDC）方面，有人推薦氟苯尼考與阿莫西林、氟苯尼考與泰樂菌素、氟苯尼考與泰妙菌素合用，這種方法欠妥，因為從藥理學的角度講，兩者不可聯合應用。但氟苯尼考可與四環素類，如強力霉素聯用。
9.氟苯尼考有血液系統毒性，雖然不會引起不可逆的骨髓再生障礙性貧血，但其引起的可逆性紅細胞生成抑制卻比氯霉素更常見。疫苗接種期或免疫功能嚴重缺損的動物禁用。
10.氟苯尼考有較強的免疫抑制作用，約比氯霉素強6倍。
11.長期使用可能會引起消化機能混亂和維生素缺乏或二重感染癥狀。
12.在防治豬病時，應小心謹慎，要按照規定的劑量和療程給藥，不能濫用，避免產生不良后果。
13.腎功能不全患畜要減量或延長給藥間隔時間。
14.當飲水劑給藥時，注意配比濃度，用藥期間只以含藥物的飲水作為畜禽的唯一水源。
15.如遇低溫，發現溶解速度較慢；或已配好的溶液有氟苯尼考沉淀析出，只需稍微加溫（不超過45℃），即可全部快速溶解。所配溶液最好在48小時內用完。按以上介紹選用適合的劑型和參照推薦添加量使用是十分安全的。個別動物可能會出現短暫的食欲下降，飲水減少或腹瀉，肌注部位略有疼痛和輕微的組織反應現象，這些都屬正常，停藥后即可恢復正常。
16.氟苯尼考為動物專用藥物，不與人類形成交*耐藥性。在治療劑量內使用，無毒副作用。對環境無危害。美國FDA規定，停藥期為28天。我國農業部有關規定（暫定）：畜禽為30天；肉雞為10天；水產類為7天；不同年齡和體重的豬均可使用，但育肥豬最好不使用，更不能長期使用，避免藥物殘留。
