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導致口蹄疫疫苗免疫失敗的原因主要有以四個方面：
一、疫苗免疫劑量因素
免疫劑量是影響豬口蹄疫免疫效果的主要因素。我們在養豬生產實踐中經常遇到養豬戶按照疫苗使用說明書接種豬口蹄疫疫苗（小豬1 mL/ 頭、中大豬2 mL/ 頭），但是免疫效果并不理想，豬只得不到很好保護。而進行適當加大免疫劑量后，就能得到較高的保護率。這說明某些廠家生產的疫苗抗原含量不足，接種后就不能刺激機體產生足夠的抗體，使免疫保護不夠，造成免疫失敗。而我們過度的將疫苗的接種劑量加大，也造成免疫麻痹或出現較強的應激反應，導致機體免疫應答能力降低，抗體水平也上不去。
二、免疫抑制性疾病影響了免疫效果
隨著養豬數量的急劇增多，豬的疫病種類也越來越多的，尤其是近幾年來，豬的免疫抑制性疾病呈逐年上升趨勢。如豬繁殖與呼吸疾病綜合征、豬瘟、圓環病毒病、偽狂犬病等疫病的發生導致免疫系統受損，機體不能對疫苗產生有效的免疫應答，一些免疫抑制性疾病日趨嚴重，導致雖然經過免疫接種，仍造成免疫失敗。另外，養殖戶經常使用一些免疫抑制性藥物，如氯霉素、磺胺類等，可導致機體白細胞減少，從而影響免疫應答，造成免疫失敗。
三、免疫程序不合理的影響
每個規模豬場都制定有自己的免疫程序，但有些場卻沒把口蹄疫列入到免疫程序中，仍和散養戶一樣，春秋各免疫一次，造成免疫水平低。疫苗使用說明書中標注的免疫期為4～6個月，但在生產實踐中很難保持6個月，一般4個月時抗體效價降低，就應該及時進行加強免疫。另外，免疫次數、時間間隔不當，一般來說，豬口蹄疫免疫一次難以產生免疫抗體的效果，必須要免疫兩次，才能產生較高的抗體水平。
四、疫苗接種操作不正確
疫苗開啟后不能在2 小時內使用完，太陽光照射使疫苗失效；免疫注射時，疫苗外漏造成免疫劑量不足或漏免；追趕豬只等粗暴行為，引起豬恐慌，加劇機體應激反應。
緩解口蹄疫疫苗應激及提高疫苗免疫效果，可從以下幾點著手：
一、選擇高質量疫苗廠家
選擇知名有保障的疫苗生產廠家，確保口蹄疫疫苗質量，確保其安全性和抗原含量的有效性。
二、提高豬群健康水平
加強豬群的飼養管理，確保飼料營養的全價性，提高豬群的免疫力，建議在口蹄疫高發期，全場豬群日糧中添加0.25%奧得曼A，有效增強豬只機體抵抗力，大大降低口蹄疫發病率；保持合理的飼養密度、舒適的環境溫度和濕度、良好的通風，畜舍內噴灑護舍安，有效抑制病原菌的增殖，保持畜舍微生態平，衡為豬群創造一個的舒適繁殖、生長環境。
三、制定科學、合理的免疫程序
根據豬口蹄疫流行特點，豬口蹄疫應做好春秋冬三季節的免疫。每年春初和秋末各加強免疫一次，各間隔3～4 周再次免疫一次。為防止免疫失敗，緩解疫苗免疫應激，建議在打疫苗前后10天在豬群日糧中添加1%奧得曼A,有效緩解疫苗應激：如口吐白沫、倒地抽搐、精神沉郁，采食下降等情況，并有效促進疫苗抗體提前生成。
四、按照正確免疫操作方法進行免疫接種
疫苗開啟后要在2 小時內使用完，避免太陽光照射；免疫注射時，2～4 周齡豬應使用2.5cm 長的16 號針，耳后肌肉注射，避免疫苗外漏或漏免，發現漏免豬只及時進行補免；應選在清晨或者傍晚進行免疫注射；切忌追趕豬只等粗暴行為，避免人為應激因素的產生。
