免疫系統是身體健康的保衛系統，而腸道則是身體的免疫器官和排毒器官。身體約70％的免疫細胞都來自于腸道，腸道免疫功能在動物胎兒時期開始逐漸建立形成，應從母代開始預防。
1、腸道的免疫功能
腸道黏膜是動物體內最大的黏膜免疫器官。機體有70％的感染發生在黏膜上。黏膜接觸抗原后局部可產生各類抗體并分泌于分泌液中，其中起防御作用的是免疫球蛋白A(SIgA)。SIgA存在于腸道、呼吸道、鼻腔等表面黏膜，是分泌型免疫球蛋白，對機體局部免疫及保護呼吸道黏膜有重要作用。可阻止或抑制病原微生物粘附，可與溶菌酶共同作用溶解細菌、中和病毒以及免疫排除作用。支原體主要寄生于呼吸道上皮細胞但不進入血液，引起呼吸道纖毛脫落，肺部粘液無法排除，繼而加重呼吸道病情。腸道黏膜和呼吸道黏膜產生的SIgA抗體具有阻止支原體吸附的作用。
腸道功能與局部(滴鼻)免疫也有著重要聯系。滴鼻免疫可封鎖感染路徑且不受母源抗體干擾，是近年來免疫豬偽狂犬疫苗(gE基因缺失株)、藍耳病疫苗(R98株)等免疫的重要手段。SIgA和微褶皺細胞(M細胞)在局部免疫中發揮重要作用。M細胞是散布腸道黏膜上皮細胞間的特化的抗原運轉細胞，其作用是通過運輸抗原和微生物至基底淋巴細胞組織而激發免疫反應。M細胞將抗原傳給巨噬細胞，然后提呈給T細胞和SIgA—B細胞，引起免疫反應。腸道細菌能通過黏膜屏障易位固有層與免疫細胞相互接觸，激活穿越上皮細胞的運輸通路和持續刺激黏膜免疫系統。M細胞和SIgA的產生依賴自身、本原健康的腸道菌群和黏膜組織。
腸道具有免疫作用和吸收作用。母豬的腸道免疫功能與下代有遺傳聯系和供長特性。即使胎兒階段腸道是無菌的，但后天建立的腸道菌群取決于胚胎時期腸道的健康形成。現代化養豬生產中較大的障礙是便秘，便秘可直接造成母豬情緒低落、采食量低、泌乳量少、產程長、不發情等繁殖問題。便秘過程中，腸道在吸收營養的同時吸收宿便中的的毒素，導致肝臟中毒和腎臟的排毒障礙，毒素隨之進入血影響母乳的乳質，哺乳仔豬腹瀉的治療難度增大，畜主在患有便秘的病豬的饋料中添加鈉、鉀等鹽類輕瀉劑防治，雖然有效但損害豬的腸道免疫功能，導致豬的消化功能紊亂。
2、腸道菌群的調整
腸道菌群失衡可導致便秘、腹瀉甚至腹瀉和便秘交替的腸應激綜合征。有益菌分為原籍菌和外來菌，原籍菌就定制力能夠長期粘附在腸道黏膜上，而外來菌在腸道內不具有定制力，在腸道內存活時間一般不超過7天。有益菌是按照屬、種、株3個層次劃分的，每種動物腸道內的有益菌群結構都不盡相同，找到適合豬腸道菌群生長的有益菌來補充可用于暫時輔助性調節腸道菌群失衡。市場上雖然有很多含有益菌類的飼料添加劑，但并非都具有調節腸道菌群的功效。因為胃酸具有很強的殺菌功能，90％益生菌在經過食道、胃部時會被殺死，剩余的益生菌能到達腸道。無論是便秘或腹瀉所引起的腸道菌群失衡對腸道健康都有著不可逆轉的傷害。
3、腸道內環境的調整
健康腸道的調節需從豬的飲食入手，提供全價飼料、適量的粗纖維和優質的維生素，同時可采取一些輔助性的調整腸道功能的方法，如飼料中添加酶制劑、酸化劑及中草藥。酶制劑可有效的降低食糜粘度，預防母豬便秘，促進消化吸收，提高商品豬生長速度。酶制劑的缺點是見效較慢，常常影響整體應用效果。酸化劑(如檸檬酸)是添加于飼料中物質，用于調整胃微生態系統，補充仔豬胃液分泌不足或胃酸分泌力下降，保持胃內pH值穩定，可有效激活消化酶，提高飼料利用率。日糧中添加1.5％的檸檬酸時，胃腸道大腸桿菌的生長受到抑制，乳酸桿菌的繁殖顯著增加。仔豬從出生后開始其胃酸分泌能力是需要一段時間逐漸達到正常水平的，胃酸分泌不足或分泌紊亂可以導致消化道其它部位的異源菌，如葡萄球菌、克雷伯氏菌等在胃內的定植，造成胃微生態平衡失調。酸化劑通過補充胃酸分泌不足，使胃提早酸化的作用，降低胃內pH值，促進有益菌大量繁殖并形成優勢菌群，抑制或殺滅有害菌，調節微生態平衡。在飼料中添加保健產品“護仔康1號”， 其中的復合酶制劑和酸制劑，降低仔豬胃PH值，能改善胃腸道微生態環境，促進有益菌群生長，提高飼料利用率。

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