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其中上海申聯生物制品有限公司目前僅生產豬口蹄疫合成肽疫苗。以上生產企業的生產設施均進行了GMP改造并通過了農業部的GMP驗收。疫苗生產工藝的全過程嚴格實行GMP管理。
國內取得生產文號的豬口蹄疫疫苗品種主要有：O型滅活疫苗和合成肽疫苗。已經獲得新獸藥證書，尚未取得生產文號的豬口蹄疫是O型基因工程疫苗。
已注冊用于生產豬口蹄疫滅活疫苗毒種主要有：
O型：OS/99，OR/80、OZK/93主要用于O型口蹄疫滅活疫苗生產。
亞洲I型：AKT/03、LC/96、KZ/03、Asia-1-JSL/HeNZK/06。
從2008年開始，根據亞洲I型的流行趨勢及實際保護效果，農業部規定，對于口蹄疫O型、亞洲I型二價滅活疫苗生產，亞洲I型部分統一采用Asia-1-JSL/HeNZK/06株。
從2009年開始豬用口蹄疫滅活疫苗在原有種毒基礎上增加OZK/93株，生產雙組分疫苗。
