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動物在疫病挑戰以后，由于免疫系統的激活，機體合成大量細胞因子、化學因子、急性期蛋白質、免疫抗體等，代謝率明顯增強，產熱增加及體溫升高，需要大量的養分。本文來自豬場動力網。首先需要大量的氨基酸合成急性期蛋白質、抗體及其他活性物質，體蛋白質損失、氮排出量增加。在疫病挑戰時，由于動物的食欲和采食量大幅減少，甚至絕食，氨基酸的供應主要來源于體蛋白的降解。在疫病挑戰時動物代謝增強，必然增加維生素和微量元素的需要量。另一方面疫病挑戰導致動物氧化應激，產生大量自由基，對抗氧化劑(VE,VC,Se等)消耗增加。
現在基本清楚，在疫病挑戰時，動物代謝增強，對養分的需要增加，動物的營養分配從生長轉向免疫。動物的這些代謝反應是為了抗御疫病，盡可能存活下來，這是長期進化或自然選擇的結果。但是，在人工選擇下，豬在疫病挑戰時的代謝模式有一定的偏離自然選擇的軌道。近年來豬的育種進展使得豬的生長潛力大幅提高，瘦肉生長速度大幅增加。這樣的豬一旦受到感染，可利用養分的分配模式發生一定程度的改變：分配到免疫系統的養分減少，分配到生長的養分增加。在健康的條件下，這自然對提高生產性能有利(豬的選育是在非常健康條件下進行的)，但在疫病挑戰時，這樣的豬免疫力較低，死亡率高于老品種(我國的地方豬生長緩慢，但抗病力遠遠高于現代外來豬)。持續地專注于提高生長性能的選擇，在基因上改變了養分的分配，必定犧牲生長以外的功能。因此，飼養高生長潛力瘦肉型豬，必須提供高的營養水平，特別在疫病挑戰時保證營養的供應才能有足夠的養分用于免疫，豬才能戰勝疫病。
雖然動物遭受疫病挑戰營養的需要增加，但令人難以理解的是，動物的反應正相反，采食量降低。其中的機理可能還得從進化的角度理解。這種反應必定有進化基礎，是編入動物的DNA遺傳中的，在自然條件下也有利于動物的生存。在進化中，自然界的豬生病后獲得營養的機會極小，而免疫需要的營養很高，唯一可靠的營養來源就是體儲備，大量動員體儲備就成為生病動物的必然。這可能由一系列神經、內分泌、活性物質分泌導致的代謝改變引起。如皮質激素上升，胰高血糖素升高，兒茶酚胺激素水平上升，胰島素水平下降。動物耗氧增加，糖原分解增強，線粒體氧化代謝產生大量ATP，可能反饋抑制了動物的食欲。本文來自豬場動力網。這還是假設，需要研究證實。在飼養條件下，即使發病，我們需要盡可能多讓豬從飼料獲得足夠養分(設法讓豬采食)，特別是免疫所需要的養分，保證充分的養分用于免疫，盡量減少分解體組織，體組織一旦耗竭，死亡是必然的結局。
疫病挑戰導致動物生長降低甚至停止，這種采食和生長的下降不是病原本身對動物的傷害造成的，而是動物對疫病挑戰的免疫反應造成的。免疫系統激活產生的一系列代謝變化和大量產生的炎性細胞因子在消滅病原的過程中也對動物的生產性能造成嚴重損傷。不僅病原，其他激活免疫反應的，如疫苗接種，也在一定程度上降低動物的生長性能。雖然動物的免疫反應是動物保持健康(或存活)的必須，但動物為此也付出了采食和生長下降的代價。免疫系統有時可能反應過度，特別是在遭遇病毒感染后，產生過量的炎性細胞因子，損傷動物自身組織。免疫反應失控，嚴重時導致動物死亡。例如導致SARS病人死亡主要是免疫反應過度，這時適當抑制一下免疫反應反而讓病人有機會活下來，看來免疫是一把雙刃劍。
