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糞便
1、飼料應采用合理配方，提供理想蛋白質體系配，以提高蛋白質及其它營養的吸收效率，減少氮的排放量和糞的生產量。
2、清糞工藝：所有豬場使均使用干清糞工藝，飼養員要及時將糞單獨清出，不可與尿、污水混合排出，運至貯糞場。
3、糞便的處理：各豬場必須建有貯糞場地，位于主導風向的下風向或側風向處，且貯糞場必須采取有效的防滲工藝，以防止糞便污染地下水。糞便的處理第一可以運至公司的有機肥料廠生產有機肥，第二采用好—氧發酵的方法，以殺死病原菌和蛔蟲卵，實現無害化。
污水
1、各豬場的排水系統應實雨水和污水兩套排水系統，以減少排污的壓力。
2、所有產生的污水嚴禁未經處理直接排放。建有污水處理設備的豬場必須經綜合處理，達到排放標準后，方能排放。沒有建污水處理廠的老豬場，必須建有污水沉淀、過濾系統，污水經沉淀、過濾接近排污標準后方可排放。各場均要盡量減少水的用量，即減小排污壓力，又節約水源。
病殘死豬的處理
1、所有豬場病殘死豬嚴禁出售、嚴禁隨意丟棄，必須及時處理。
2、具備焚燒條件的豬場，病殘死豬的尸體必須采取焚燒爐焚燒。
3、不具備焚燒條件的豬場，必須設置兩個以上的混凝土結構的安全填埋井(化尸池)，且井口要加蓋封嚴。每次投入豬尸體后，應覆一層厚度大于10cm的熟石灰，井填滿后，須用土填埋壓實并封口。
豬場廢棄物
廢棄物包括過期的獸藥、疫苗、注射后的疫苗瓶、藥瓶及生產過程中產生的其它棄物。各種廢棄物一律不得隨意丟棄，應根據各自的性質不同采取煮沸、焚燒、深埋等無害化處理措施，并要求填寫相應的無害化處理記錄表。
