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1 疾病表現復雜，診斷困難
目前，多病原混合感染已成為豬病發生的主要形式，使得臨診表現和病理變化不及單純感染那么典型，同時，非典型化病例的出現，使得豬病診斷更加困難。臨床實踐中，豬病診斷方法有流行病學診斷、臨診診斷、病理學診斷、微生物學診斷、血清學診斷及分子生物學診斷。但是，基層獸醫常用的方法仍是流行病學診斷、臨診診斷或病理學診斷，有些甚至不會病理剖檢，因此，診斷只憑經驗，結果可想而知。疾病診斷是治療的前提，若診斷差之毫厘或錯誤，治療則謬以千里。因此，當前豬病治療難的主要原因之一就是診斷困難。
對策：掌握豬病診斷方法，拓寬疾病診斷思維。在掌握傳統診斷方法同時，豬病實驗室診斷技術將是今后豬病診斷的重要方向。因此，建議有條件的豬場或獸醫門診最好設豬病診斷實驗室，規格不必太高，能進行常規細菌病和寄生蟲病診斷，能利用診斷試劑盒、膠體金試紙等進行快速檢測即可。
2 混合感染，影響療效
當前豬病流行特點之一就是多病原引起的混合感染，如細菌與細菌、細菌與病毒、病毒與病毒或與寄生蟲等。豬一旦發病，多為混合感染。多重感染帶來的后果就是增加了診斷和防制的難度。同種治療方法在單純感染和混合感染病例上呈現出的療效存在差異。原因在于細菌混合共存，其中一些菌能抵御或破壞宿主的防御系統，使共生菌得到保護。更為重要的是混合感染常使抗生素活性受到干擾，體外藥敏試驗常不能反映出混合感染病灶中的實際情況，故增加了治療難度。
對策：加強飼養管理，搞好環境衛生，增強豬體抵抗力。正所謂“正氣存內，邪不可干”。制定嚴格的消毒制度，科學選擇和使用消毒藥。根據當地疾病流行情況和豬場實際情況，制訂切實可行的免疫程序，不可盲目照搬。
3 免疫抑制病危害嚴重
免疫抑制是由于免疫系統受到損害，導致機體對抗原應答能力下降，對疾病敏感性增強的一種免疫異常狀態。引起免疫抑制的病因有非傳染性因子和傳染性因子兩大類。非傳染性因子有霉菌毒素、營養缺乏(如微量元素、維生素等)、藥物因素(如氨基糖苷類、四環素類等)及應激因素等。傳染性因子有豬圓環病毒、、圓環病毒感染等。因此，對于目前尚無有效治療藥物的疾病來說，治療難度可想而知。
對策：預防為主，在做好飼養管理同時，若有商品化疫苗，可用疫苗免疫預防，減少此類病的發生。一旦發病，以控制繼發感染，提高機體抵抗力為主，同時，可以疫苗緊急接種，是控制病毒性疾病的重要手段。
5 獸藥質量存在問題
目前我國雖有1464家生產企業通過GMP認證，但獸藥質量仍不容樂觀。在農業部每期公布的不合格獸藥企業名單里，所謂知名企業，也屢次上榜，更不用說那些套牌企業。目前，獸藥存在的問題主要有：生產和流通假冒獸藥;添加違禁藥物成分，如抗病毒西藥;含量不足，有些甚至查不到藥物成份;包裝標示藥物與實際所含藥物不同;添加不明物質，干擾獸藥的正常檢測。因此，拿著假冒偽劣獸藥、含量不足的獸藥去治病，效果可想而知。
對策：選擇有信譽度、知名度和大家認可的獸藥公司產品，密切關注農業部發布的不合格獸藥企業名單及產品名稱。同時，獸藥行政管理管門應加強監管，嚴禁假冒偽劣獸藥的生產和流通。只有從生產、流通等多個環節下手，加大懲罰力度，才能有效遏制假冒偽劣獸藥流通。
