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1、酚類
優點：性質穩定，在酸性中作用較強。
缺點：有特殊氣味；對皮膚有刺激作用；使紡織品染色和損壞橡膠；對動物體毒性較強。
舉例：如石炭酸、煤酚皂溶液(來蘇兒)
2、醇類
優點：作用快，性質穩定；基本無毒，無腐蝕性；
缺點：不能殺滅細菌芽孢、真菌和病毒。
舉例：如乙醇。70%乙醇相當于3%苯酚。
3、酸類
A無機酸：
作用機理；殺菌作用取決于離解的氫離子，高濃度的氫離子使菌體蛋白變性、沉淀或水解，從而殺死繁殖型微生物與芽孢。
缺點：腐蝕性較強、穿透力較差。
舉例：鹽酸、硫酸、硼酸、硝酸等。
B有機酸：
作用機理：殺菌作用取決于不電離的分子，它透過細菌的細胞膜而對細菌起殺滅作用。
優點：對革蘭氏陽性、陰性菌均有殺滅和抑制作用，也可殺滅流感病毒。
缺點：堿性環境下效果較差，殺菌作用較弱。
C檸檬酸的缺點：
①澳大利亞獸醫防疫計劃不推薦用于非洲豬瘟、典型豬瘟、禽流感、新城疫、小反芻獸疫、牛瘟、口蹄疫、水皰性口炎；
②英國農業漁業食品部允許用于口蹄疫；
③有有機物時降低消毒效果：對金屬有腐蝕性；對水生動物有毒。
4、堿類
作用機理：氫氧根離子使蛋白質水解、變性或沉淀。
優點：可殺滅細菌繁殖體、芽孢；對病毒有較強的殺滅作用；對寄生蟲卵也有殺滅作用。
缺點：易灼傷組織，有腐蝕性，不適用于水的消毒，極易吸濕受潮，成分單一，殺毒范圍窄，粗制品含量低。
舉例：如氫氧化鈉、生石灰。
火堿消毒的缺陷：有有機物時降低消毒效果；無表面活性作用；灼傷皮膚、眼睛、呼吸道和消化道；易吸潮，導致結塊、失效；腐蝕金屬，破壞環境；只能用于空舍消毒；澳大利亞獸醫防疫計劃規定不能用于部分烈性傳染病；美國農業部不推薦用于非洲豬瘟和典型豬瘟；英國農業漁業食品部僅允許用于豬水皰病。
5、醛類
作用機理：使蛋白質變性，發揮殺菌作用。
優點：殺菌作用較醇類強，殺菌譜廣泛且作用強，對細菌繁殖體、芽孢、病毒和真菌均有殺滅作用。可硬化組織。
缺點：使用受限，有刺激性、毒性，長期使用會致痛，易造成皮膚上皮細胞死亡，受污物、溫度、濕度影響較大。易產生過敏，可以引起哮喘。
甲醛的缺點：消毒效果受溫度影響大，低溫無效；有機物和低PH值均會使其失去消毒效果：高毒和高刺激性，引起氣喘病，具有潛在的致癌性；稀釋比例小，用量大；澳大利亞獸醫防疫計劃不推薦用于非洲馬瘟、口蹄疫、豬水皰病、小反芻獸疫、裂谷熱、牛瘟、水皰性口炎；英國農業漁業食品部允許用于口蹄疫和豬水皰病，稀釋濃度為1：9。
6、氧化劑
作用機理：通過氧化細菌體內的活性基團，破壞菌體蛋白或酶蛋白。
優點：作用快而強，廣譜殺菌。對細菌、病毒、霉菌和芽孢均有效。
缺點：僅對表面有作用，易分解，不穩定。
舉例：過氧乙酸。
7、鹵素類
作用機理：通過鹵化、氧化作用使有機物分解或喪失功能。
缺點：對金屬腐蝕性大，用量大；使用條件受限，易分解。
舉例：威島、消毒王、百菌清。
碘制劑的缺點：效果短暫，消毒池消毒一天即可失效；在陽光下易分解，易產生污點；對水生動物有一定的毒性；有機物存在時效果降低；對口蹄疫病毒作用慢，2―3%需要1小時才能殺死。
8、重金屬鹽類
作用機理：離子與菌體蛋白結合，產生沉淀。高濃度殺菌，低濃度抑菌。
優點：防腐作用較強。
缺點：污染大，僅對細菌和真菌有效，低溫、有機物能降低效果。
9、表面活性劑
作用機理：改變細胞的通透性，并使菌體蛋白變性。
分類：陰、陽、非離子和兩性離子。
優點：殺菌作用強，無腐蝕、刺激性和漂白性，易溶于水，不污染物品。在堿性和中性介質中殺菌力強。
缺點：在酸性介質中效果大減，對結核桿菌、綠膿桿菌、芽孢、真菌和病毒的效果較弱。
舉例：百毒殺、新潔爾滅。
10、季銨鹽消毒劑的缺點
A只對細菌有效，對病毒幾乎無效；
B在有機物存在條件下幾乎無效；
C對水生動物毒性較大。
在生產實踐中，情況比較復雜，對消毒劑的要求很高。當有機物存在(糞、尿、泥土等)，病原微生物數量大、種類多，溫、濕度變化大，被消毒物品表面結構各異，水質(硬度、酸堿度)差異大時，復合消毒劑是理想選擇。
試驗證實單純地使用單一的化學品消毒劑不能滿足良好生物安全計劃的要求；單一消毒劑都存在著一些固有的缺陷：穿透有機物能力弱，受環境溫度影響大，使用濃度高，越來越嚴重的安全問題，價格優勢的喪失等。只有復合型消毒劑才能聚眾家之所長，達到綜合生物安全計劃的要求。
