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消毒包括大環境消毒、帶豬消毒、全進全出空欄消毒、手術、閹割消毒以及獸防人員進出豬舍消毒及器械消毒等。
一、環境消毒
主要指場內的交通要道、大小路徑和圈前圈后的消毒，可利用2%的火堿或0.2%～0.3%的過氧乙酸進行高壓噴爰消毒，正常情況下每月消毒2次。
二、消毒池的消毒
豬場的各類消毒池統一用2%～3%的火堿水，每隔3～4天更換一次，但要始善保持池內有適量的消毒液。另外種豬群為防蹄病，消每池內可使用l：80的消毒威，或者二者交替使用。出入豬舍的人員必須經消毒池進行鞋底消毒。
三、全進全出空欄消毒
1、首先要徹底清除欄圈內的一切糞尿、污水和雜物。
2、用高壓噴水搶由上至下徹底沖洗頂棚、墻壁及欄架等。
3、待水干燥后用過氧乙酸或甲醛或用2%～3%的火堿水徹底沖洗。經過l0～l2小時后，再用清水徹底沖洗欄圈地面，待干燥后，再用)0.2%～0.3%過l乙酸或1：800的消毒威噴霧消毒。
四、帶豬消毒
種豬、后備豬舍每周消毒l次；產房每周消毒可利用消毒1~2次；保育舍每周消毒1~2次；育肥舍每周消毒1次。如果發生疫情，消毒次數可適當增多。
五、手術、閹割消毒
1、手術部位首先要用清水洗凈擦干，然后涂以3%的碘酊，待干后再用70～75%的酒精消毒，待酒精干后方可實施手術，術后創口再滌3%碘酊。
2、閹割時，切口部往：專用70～75%的酒精消毒，待酒精干后方可施行閹割，結束后刀口處涂以3%碘酊。
3、斷尾時，尾巴斷端要涂以3%磣酊。
六、器械消毒
手術刀、手術剪、縫合針、縫合線可甩煮沸消毒，也可用0.1%新諸奪滅浸泡消毒或者70～75%的酒精消毒。注射器、針頭必須煮沸消毒。
七獸醫防疫人員出入豬毒消毒
1.獸醫防疲人員進入豬舍必須孝消毒池內進行鞋底消毒，在消毒盆內洗手消毒。
2.出舍時要在消毒盆內洗手消毒。
3.獸醫防疫人員在一棟豬舍工作完畢后，要甩消毒液浸泡的紗布擦洗注射器和提藥盒的周圍，進行鞋底和手消毒后方可進入另一棟豬舍。
