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消毒的目的是殺滅病原體，豬的分泌物、排泄物，病豬的糞尿、血液及其分泌物，被病豬污染的土壤、用具、畜舍等要定期進行消毒，
日常消毒，是豬場最重要的防疫措施。
大門消毒：主要供出入豬場的車輛和人員通過，要避免日曬雨淋和污泥濁水入內，池內的消毒液2～3天徹底更換一次，所用的消毒劑要求作用較持久、較穩定，可選用氫氧化鈉(2%)、過氧乙酸(1%)等。消毒程序為：消毒池加入20厘米深的清潔水→測量水的重量/體積→計算→添加、混勻。
車輛消毒：進出豬場的運輸車輛，特別是運豬車輛，車輪、車廂內外都需要進行全面的噴灑消毒，采用的消毒劑對豬無刺激性、無不良影響，可選用過氧化氫溶液(0.5%)、過氧乙酸(1%)、二氯異氰尿酸鈉等。任何車輛不得進入生產區。消毒程序為：準備好消毒噴霧器→根據消毒桶/罐中加水的重量/體積、消毒液濃度、消毒劑的含量，計算消毒劑的用量，加入、混勻→噴灑從車頭頂端、車窗、門、車廂內外、車輪至上而下噴灑均勻→用清水清洗消毒機器，以防腐蝕機器→3~5分鐘后方可準許車輛進場。
豬舍大消毒：豬舍大消毒是指全進全出的豬舍消毒。產房、保育舍、育肥舍等每批豬調出后，要求豬舍內的豬只必須全部出清，一頭不留，對豬舍進行徹底的消毒。可選用過氧乙酸(1%)、氫氧化鈉(2%)、次氯酸鈉(5%)等。消毒后需空欄5～7天才能進豬。消毒程序為：徹底清掃豬舍內外的糞便、污物、疏通溝渠→取出舍內可移動的部件，如飼槽、墊板、電熱板、保溫箱、料車、糞車等，洗凈、涼干或置陽光下暴曬→舍內的地面、走道、墻壁等處用自來水或高壓泵沖洗，欄柵、籠具進行洗刷和抹擦→閑置一天→自然干燥后才能噴霧消毒(用高壓噴霧器)，消毒劑的用量為1升/平方米→要求噴霧均勻，不留死角→最后用清水清洗消毒機器，以防腐蝕機器。
產房要嚴格消毒，母豬進入產房前進行體表清洗和消毒，母豬用0.1%高錳酸鉀溶液對外陰和乳房擦洗消毒。仔豬斷臍要用5%碘酊嚴格消毒。
帶豬消毒：當某一豬圈內突然發現個別病豬或死豬，若疑傳染病時在消除傳染源后，對可疑被污染的場地、物品和同圈的豬所進行的消毒。可選用新潔爾滅(1%)、過氧乙酸(1%)、二氯異氰尿酸鈉等。消毒程序為：準備好消毒噴霧器→測量所要消毒的豬舍面積而計算消毒液的用量→根據消毒桶/罐中加水的重量/體積、消毒液濃度、消毒劑的含量，計算消毒劑的用量，加入、混勻→噴灑從豬舍內頂棚、墻、窗、門、豬欄兩側、食槽等，至上而下噴灑均勻→最后用清水清洗消毒機器，以防腐蝕機器。
空氣消毒：在寒冷季節，門窗緊閉，豬群密集，舍內空氣嚴重污染的情況下進行的消毒，要求消毒劑不僅能殺菌還有除臭、降塵、凈化空氣的作用。采用噴霧消毒，消毒劑用量0.5升/立方米。可選用過氧乙酸(1%)、新潔爾滅(0.1%)等。消毒程序為：準備好消毒噴霧器→測量所要消毒的豬舍體積而計算消毒液的用量→根據消毒桶/罐中加水的重量/體積、消毒液濃度、消毒劑的含量，計算消毒劑的用量，加入、混勻→細霧噴灑從豬舍頂端，至上而下噴灑均勻→最后用清水清洗消毒機器，以防腐蝕機器。
飲水消毒：飲用水中細菌總數或大腸桿菌數超標或可疑污染病原微生物的情況下，需進行消毒，要求消毒劑對豬體無毒害，對飲欲無影響。可選用二氯異氰尿酸鈉、次氯酸鈉、百毒殺(季胺鹽類消毒劑)(0.1%)等。消毒程序為：儲水罐/桶中儲水重量/體積→計算消毒劑的用量→加入、混勻→2小時后可以引用。
器械消毒：注射器、針頭、手術刀、剪子、鑷子、耳號鉗、止血鉗等物品的消毒，洗凈后，置于消毒鍋內煮沸消毒30分鐘后即可使用。
環境消毒：豬場道路和環境要保持清潔衛生，每天堅持打掃豬舍衛生，保持料槽、水槽、用具干凈，地面清潔，選用高效、低毒、廣譜的消毒藥品，定期消毒。
注意事項
應用兩種以上的消毒劑交替使用。每次消毒時，應先將糞尿打掃干凈，用消毒劑(稀釋后)進行噴霧帶豬消毒。 豬場門衛消毒豬舍大消毒環境消毒注意事項。
