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1.飼料的防霉
飼料的防霉是從根本上解決霉菌毒素產生的有效途徑。應從以下幾方面著手：
首先，必須嚴格控制原料水分，一般要求玉米、高粱、稻谷等不超過14%；大豆及其餅粕、麥類、次粉、糖麩類。甘薯干、木薯干不超過13%；棉籽餅粕、菜籽餅粕、向日葵仁餅粕、亞麻仁餅粕、花生仁餅粕、魚粉、骨粉及肉骨粉不超過12%。
其次，要保持飼料原料的新鮮程度。
再次，應控制飼料加工過程中的水分和溫度，最好應用HACCP質量檢測系統。，由于霉菌更易在被破壞的或已加工的谷物上生長，所以這一過程顯得尤為重要。
最后，可應用飼料防霉劑。以丙酸及其鹽類為主要成分的產品在抑制霉菌生長上是非常有效的，現在多采用由多種由機酸防霉劑按一定比例配合而成的復合型防毒劑，以增加防霉效果。除此以外。美國農業部（USDA）的研究者們正在培育能夠抵抗黃曲霉毒素的玉米新品種，但商業化向市場推廣還需要一定的時間。
2. 霉變飼料的處理與利用
霉菌毒素污染嚴重的飼料，應該廢棄。對于輕度污染的飼料，經適當的處理后可以達到飼用標準的，仍可利用。
2.1分離與混合法脫毒
降低或消除霉菌污染的最常用的方法是將被霉菌污染的籽實分離出來。另一種辦法是將已被霉菌毒素污染的飼料用未污染飼料混合稀釋。用上述方法都需要耗費大量的時間和勞力，當污染較普遍時，此種方法收效甚微。
2.2利用飼料吸附劑脫毒
一些礦物質能夠吸附并捕獲霉菌毒素分子。如硅酸鋁鹽、沸石、膨潤土、活性炭、硅藻土等。Jindal等（1994）研究發現：在含有500μg/kg黃曲霉毒素B1的雞飼料中添加 200mg/kg的活性炭，對于減少毒素的有害影響頗為有效。此外，國外大量報道，添加水合鋁硅酸鈉鈣（HSCAS）可顯著減輕霉菌毒素的有害影響，但大量添加這類吸附劑會降低養分濃度。
2.3利用蛋氨酸脫毒
肝臟能夠凈化被動物吸收的霉菌毒素，此凈化的過程基于谷胱甘肽的的氧化還原反應，而蛋氨酸有利于谷胱甘肽的組成，因而額外添加蛋氨酸可以減少對動物生長和其他性能產生的不利作用。
2.4酵母菌細胞壁制劑脫毒
利用酵母菌細胞壁特有的吸咐能力來稀釋某些霉菌毒素，一般常用酵母菌為 Saccha-romyces cerevisiae種1026（Yea-Sacc）。實驗室測定結果顯示。在懸滴反應中有90%以上的黃曲霉素素結合在酵母菌細胞壁上。利用由酵母菌細胞壁提煉而成的配制有機吸附劑，可能會在控制動物飼料中霉菌毒素上成為一個重要的手段。
現有研究結果表明，從酵母細胞壁提取酯化葡甘露聚糖物質（Esterified glucomannans）是一種較好的霉菌毒素結合劑。它較活性炭或水合鋁硅酸鈉鈣（HSCAS）對霉菌毒素有更強的專一親和性，所以對礦物質代謝的干擾作用不顯著。Diaz等（1999）在奶牛的精料混合料中添加 500g/t的酯化葡甘露聚精物質可以使牛奶中的黃曲需毒素水平下降。
2.5 酶制劑的應用
采用酶制劑來分解霉菌毒素是一項新的技術。基于大多數霉菌毒素易于在肝臟中被微粒體氧化而分解，可以采用能增強霉菌毒素代謝中酶的活性的制劑，加快毒素的分解，從而減輕毒素的危害。如酯酶能夠破壞玉米赤霉烯酮的內酯環，而環氧酶能分解單端孢霉毒素的12和13環氧基。
